中國科學家自主完成首個果樹作物基因組序列圖譜

來源:中新網 2012-03-21 17:01 http://www.xbkwei.com/ 海峽都市報電子版

　　海都閩南網訊中新社武漢3月21日電 (記者艾啟平)華中農業大學21日對外公布一項重大科研成果：由該校中國工程院院士鄧秀新領銜的研究團隊完成了甜橙基因組拼接與注釋，獲得了較高質量的甜橙基因組。這是中國自主完成的首個果樹作物基因組序列圖譜，也是目前全球最完整的甜橙基因組圖譜。

　　柑橘是世界重要的果樹之一，而甜橙是世界第一大柑橘類型，其產量占全世界柑橘產量的60%左右。中國是世界上重要的柑橘原生中心，從2008年起，無論是從種植總面積還是總產量，中國已經超越巴西成為世界柑橘第一大生產國。

　　專家稱，甜橙具有多胚、遺傳背景高度雜合等特點，阻礙了遺傳學及育種發展。完整的基因組信息，作為一個遺傳框架，將為柑橘遺傳與育種改良提供依據。

　　據介紹，甜橙基因組計劃于2011年啟動。該基因組測序采用全基因組鳥槍法策略，分別構建了多個不同插入片段長度的文庫，進行雙末端測序。拼裝后的序列覆蓋87%的柑橘基因組，獲得注釋的基因約3萬個。通過遺傳標記和染色體原位雜交分析，將基因組序列整合到9條染色體。專家研究發現，甜橙基因組中有51%的基因位點處于雜合狀態。

　　鄧秀新院士介紹，甜橙基因組的完成，將為國內外同行研究蕓香科(柑橘)的特殊生物學性狀、功能基因組提供重要平臺。同時，對于果實包括色、香、味、成熟期等重要性狀基因的發掘及品種改良具有重要意義。這一重要成果發表在http://citrus.hzau.edu.cn網站上，為國內外學術研究提供免費數據分析。

　　目前，果樹作物包括葡萄、番木瓜、蘋果、草莓、可可、椰棗等基因組，國際上已發表。國際柑橘基因組計劃2003年啟動，2011年1月釋放了克里曼丁橘的基因組草圖。但克里曼丁橘主要在地中海地區栽培，其產量只占柑橘總產量10%。因此，美國、巴西和中國等國科學家都期望獲得高質量的甜橙基因組圖譜。